南少林寺遺址位于莆田荔城區(qū)西天尾鎮(zhèn)九蓮山林山村，距市區(qū)約17公里。九蓮山中有座林泉院，始建于南朝陳永定元年（557年），至北宋嘉佑年間（1056-1063），此寺已形成很盛的武風(fēng)，成為我國東南沿海武術(shù)活動(dòng)的中心。相傳河南嵩山少林寺13武僧幫助唐太宗統(tǒng)一中國后，唐太宗賜于“僧兵”，并準(zhǔn)許在全國各地建立十座分寺。據(jù)考，荔城區(qū)九蓮山的林泉院，就是少林寺十座分寺中較早創(chuàng)建的分寺之一。因?yàn)橐?guī)模宏大（占地約三萬平方米），武風(fēng)鼎盛，影響南中國，故稱之為南少林寺。據(jù)考，該寺于清初被清兵焚毀。

　　1986年至1988年，原莆田縣在文物普查中，發(fā)現(xiàn)了這座湮滅了幾百年的寺院遺址，經(jīng)過認(rèn)真發(fā)掘，發(fā)現(xiàn)了5個(gè)刻有“僧兵”、“諸羅漢浴煎茶散”等文字的北宋石槽。史載，只有少林寺才能冠之以“僧兵”二字。據(jù)此，經(jīng)國家文物局批準(zhǔn)，1990年12月，福建省考古隊(duì)對(duì)九蓮山寺院遺址進(jìn)行考古發(fā)掘，出土了“真覺大師 革隹 堤之塔、林泉院、天佑”唐代石刻和“長興四年歲次癸巳正月”等字樣的南唐陶質(zhì)鴟尾等珍貴的歷史文物。

      1992年4月25日，南少林遺址論證會(huì)暨重建莆田九蓮山南少林寺新聞發(fā)布會(huì)在北京人民大會(huì)堂舉行。1998年12月8日，九蓮山南少林寺重建工程竣工，開始向海內(nèi)外開放。為了更好發(fā)展莆田南少林，2007年莆田南少林寺恢復(fù)宗教活動(dòng)。

      1986年，莆田市在西天尾鎮(zhèn)北部層巒疊嶂中的九蓮山麓發(fā)現(xiàn)一處古建筑遺址，以及五口建造于北宋年間的大型花崗巖石槽殘碑、石柱等，學(xué)者們從石槽長226厘米、寬100厘米，槽旁刻有“諸羅漢浴煎茶散”字樣，判斷這是僧兵治療傷病用的石槽，又從殘碑、石柱上的“林泉院”、“寺山界”字樣，最引人注目的是那口重達(dá)數(shù)千斤的宋代石槽，槽上刻有“當(dāng)院僧兵永其佳其合共造石槽一口”，推測此遺址可能是南少林寺遺址。九蓮山南少林寺海拔500多米，地形酷似河南的山間盆地，居九華山脈中段，地勢(shì)十分險(xiǎn)要，是理想的兵家用武之地。山間盆地小平原，耕植可以自給，大本營離各個(gè)隘口不過數(shù)里之遙；且坡度平緩，如有軍情，到隘口憑險(xiǎn)據(jù)守不過片刻功夫。從地理形勢(shì)上看，林山實(shí)在是個(gè)易守難攻的藏龍臥虎之地。寺區(qū)周圍有朱山、樟江、寨頭等10多個(gè)山寨。目前各寨遺址均存。山頭尾和梧桐山還有高三、四十米頗為壯觀的山澗瀑布。少林寺遺址正處在九蓮山盆地的中心，寺院的基地有兩三萬多平方米，十方叢林的氣度可想而知。清初，南少林寺因在反清復(fù)明斗爭中與天地會(huì)有著千絲萬縷的聯(lián)系，清王朝深為忌恨，遣兵焚毀，莆田南少林寺從此湮沒于歷史煙塵之中。其實(shí),林泉院于元未就已經(jīng)被焚燒畢盡了.據(jù)黃仲昭(1345~1506)《八閩通志》記載：興化府 莆田縣....資福院　北平院　林泉院　龍藏院　靈鷲院　中峰院宋天圣二年重建......通上幾九十院俱廢。所以，根本不存在清朝被焚之說。其次，院，本身就是較小的寺廟。元前，莆田的院，基本隸屬于家族祠堂。明朝洪武年間，莆田的院，紛紛升級(jí)為寺，脫離家族管理，有據(jù)可查。所以，林泉院為少林的說法，是大錯(cuò)特錯(cuò)。

       1992年4月25日，莆田市在北京人民大會(huì)堂舉行新聞發(fā)布會(huì)，正式向外界宣布發(fā)現(xiàn)南少林寺遺址，中國佛教會(huì)理事、嵩山少林寺第29代方丈德禪大師出席新聞發(fā)布會(huì)，他根據(jù)先輩叮囑，暫定了林泉院即南少林寺，并贈(zèng)送了“南少林就在福建莆田九蓮山下”的親筆題詞。現(xiàn)在，莆田南少林寺已初具規(guī)模，大雄寶殿、天王殿、鐘鼓樓、山門以及趙撲初題額的“南少林”牌坊等，巍峨壯觀，金碧輝煌。周圍的古竹寺、霞梧院、九蓮巖等大小寺院環(huán)繞著南少林寺，形成氣勢(shì)昂揚(yáng)的寺院群落，重現(xiàn)了當(dāng)年十方叢林的恢宏氣度。